23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0050 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_R0050  tRNA-Cys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000040729  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0007  tRNA-Cys  90.32 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0824294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0002  tRNA-Cys  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150631  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000388055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0014  tRNA-Cys  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000913003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0037  tRNA-Cys  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0056  tRNA-Cys  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000403241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0038  tRNA-Cys  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0047  tRNA-Cys  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0535  tRNA-Cys  94.59 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0065  tRNA-Cys  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.877098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0040  tRNA-Cys  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0042  tRNA-Cys  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.220787  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0037  tRNA-Cys  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1223  tRNA-Cys  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0426798  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0816  tRNA-Cys  96.3 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.713516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0010  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0009  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0011  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.23607  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0011  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.606624  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0030  tRNA-Cys  90.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000038111  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0065  tRNA-Cys  84.29 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>