22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2538 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2538  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  504  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1595  hypothetical protein  75.41 
 
 		 246 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.691344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6525  hypothetical protein  42.06 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3824  hypothetical protein  39.21 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0937029  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5593  hypothetical protein  41.48 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6237  hypothetical protein  42.86 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1601  hypothetical protein  36.82 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5242  hypothetical protein  36.82 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5024  hypothetical protein  34.2 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4296  hypothetical protein  32.92 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.337825 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5066  hypothetical protein  33.19 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1659  hypothetical protein  32.02 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5507  hypothetical protein  28.98 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.467204 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5193  hypothetical protein  29.49 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2985  hypothetical protein  28.45 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4407  hypothetical protein  25.42 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3233  hypothetical protein  27.83 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4312  hypothetical protein  26.23 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0067  hypothetical protein  22.7 
 
 		 240 aa  45.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.470884 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0046  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00092552 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0096  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>