244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1062 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1062  bacterioferritin  100 
 
 
161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0636  bacterioferritin  78.26 
 
 
161 aa  254  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.554542  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0949  bacterioferritin  60.65 
 
 
155 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.443443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3429  bacterioferritin  60 
 
 
155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0282624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0933  bacterioferritin  59.35 
 
 
155 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3554  bacterioferritin  60 
 
 
155 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3357  bacterioferritin  59.35 
 
 
155 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313026  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3094  bacterioferritin  59.35 
 
 
155 aa  190  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0947  bacterioferritin  58.06 
 
 
155 aa  190  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02052  bacterioferritin subunit 1  58.71 
 
 
155 aa  189  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000533514  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0945  bacterioferritin  58.06 
 
 
155 aa  189  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1112  bacterioferritin subunit 1  58.06 
 
 
155 aa  188  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0983  bacterioferritin  58.06 
 
 
155 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.383753  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0958  bacterioferritin  58.06 
 
 
155 aa  185  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.874895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3607  bacterioferritin  56.13 
 
 
155 aa  184  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300979  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2529  bacterioferritin subunit 1  57.69 
 
 
156 aa  184  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2872  bacterioferritin  60 
 
 
155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0991  bacterioferritin  55.48 
 
 
155 aa  180  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000307533  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10050  bacterioferritin protein  54.84 
 
 
154 aa  174  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618256  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2114  bacterioferritin  56.41 
 
 
159 aa  173  9e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2075  bacterioferritin  56.13 
 
 
155 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.631663  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1507  bacterioferritin  53.75 
 
 
159 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0653  bacterioferritin  56.77 
 
 
154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4521  bacterioferritin  56.13 
 
 
154 aa  171  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642969  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1384  bacterioferritin  55.77 
 
 
162 aa  171  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132522  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0482  bacterioferritin  56.13 
 
 
154 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000311349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0515  bacterioferritin  56.13 
 
 
154 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0679585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0511  bacterioferritin  55.48 
 
 
154 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150479  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5052  bacterioferritin  55.84 
 
 
155 aa  167  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1074  bacterioferritin  55.13 
 
 
160 aa  166  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434507  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0990  bacterioferritin  55.13 
 
 
160 aa  166  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1369  bacterioferritin  51.3 
 
 
159 aa  166  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1077  ferritin:bacterioferritin  52.5 
 
 
162 aa  166  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139302  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4721  bacterioferritin  54.84 
 
 
154 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3880  bacterioferritin  54.84 
 
 
154 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0865  bacterioferritin  54.19 
 
 
154 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2757  bacterioferritin  53.85 
 
 
158 aa  165  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738013  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09160  bacterioferritin  54.19 
 
 
154 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1167  bacterioferritin, subunit 1  53.42 
 
 
161 aa  161  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2231  bacterioferritin  50.32 
 
 
160 aa  160  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.704713  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2835  bacterioferritin  51.59 
 
 
157 aa  158  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0233264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3474  bacterioferritin  49.37 
 
 
161 aa  158  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  50.63 
 
 
159 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  50 
 
 
160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1283  bacterioferritin  51.23 
 
 
162 aa  150  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815462  normal  0.472736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  50.97 
 
 
156 aa  147  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01151  bacterioferritin  48.45 
 
 
165 aa  146  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  46.84 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  50.32 
 
 
158 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  50.32 
 
 
158 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  50.32 
 
 
158 aa  143  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  48.1 
 
 
159 aa  140  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  49.68 
 
 
154 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  49.36 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  45.91 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  47.74 
 
 
157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  49.68 
 
 
158 aa  137  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  50.32 
 
 
156 aa  137  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  50.65 
 
 
158 aa  137  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  50 
 
 
172 aa  137  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  48.08 
 
 
158 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  49.37 
 
 
159 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  49.03 
 
 
158 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  49.03 
 
 
158 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  49.03 
 
 
158 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  49.03 
 
 
158 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  49.03 
 
 
158 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  48.08 
 
 
157 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  45.81 
 
 
157 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  48.08 
 
 
157 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  46.45 
 
 
157 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  48.39 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  49.03 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  47.74 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  48.73 
 
 
159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  49.03 
 
 
158 aa  134  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  49.68 
 
 
154 aa  134  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  47.13 
 
 
159 aa  134  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  48.72 
 
 
157 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  49.03 
 
 
158 aa  134  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  48.08 
 
 
157 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  47.1 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  47.1 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  47.1 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  47.1 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  47.1 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  47.44 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  48.08 
 
 
158 aa  133  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  46.75 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  47.74 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  46.45 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  47.44 
 
 
157 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  45.81 
 
 
159 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  47.44 
 
 
157 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  45.81 
 
 
159 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  44.65 
 
 
158 aa  131  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  45.81 
 
 
157 aa  130  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  45.86 
 
 
224 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  45.22 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  45.22 
 
 
180 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>