20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5067 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5067  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  276  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95796  normal  0.193146 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0601  hypothetical protein  63.89 
 
 		 91 aa  87.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0491  hypothetical protein  48.24 
 
 		 87 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1285  hypothetical protein  63.51 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.62186  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1687  hypothetical protein  64.86 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.837168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4032  hypothetical protein  62.5 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0730826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0888  hypothetical protein  38.04 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481059 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4648  hypothetical protein  40.68 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170039  normal  0.0241451 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4516  hypothetical protein  40.68 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.984435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0877  hypothetical protein  33.82 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2198  hypothetical protein  39.71 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1237  hypothetical protein  31.71 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2410  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1729  hypothetical protein  36.23 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0726991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2978  hypothetical protein  48.72 
 
 		 40 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1455  hypothetical protein  34.62 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1521  hypothetical protein  34.62 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0911335 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1908  hypothetical protein  38.1 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00701296  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3643  hypothetical protein  31.58 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3029  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>