18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4230 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4230  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  325  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.081748  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1936  hypothetical protein  26.85 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191079  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0057  general glycosylation pathway protein  28.86 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0651  hypothetical protein  33.71 
 
 		 329 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0500  hypothetical protein  31.85 
 
 		 320 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0541  hypothetical protein  32.89 
 
 		 320 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3489  hypothetical protein  32.89 
 
 		 317 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3824  hypothetical protein  31.94 
 
 		 320 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3768  hypothetical protein  31.94 
 
 		 320 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2759  hypothetical protein  28.21 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.474468  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3950  hypothetical protein  31.94 
 
 		 320 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1675  hypothetical protein  27.34 
 
 		 301 aa  51.6  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.877209  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0540  hypothetical protein  31.94 
 
 		 320 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3535  hypothetical protein  29.94 
 
 		 325 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33460  general glycosylation protein  32.18 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3768  hypothetical protein  28.48 
 
 		 315 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1766  general glycosylation pathway protein  26.67 
 
 		 301 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1201  general glycosylation pathway protein  26.32 
 
 		 297 aa  43.5  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>