23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2780 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2780  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  205  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.198014  normal  0.363116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1528  hypothetical protein  57.83 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1005  hypothetical protein  54.76 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1089  hypothetical protein  51.61 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1165  hypothetical protein  51.49 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  60 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2823  hypothetical protein  49.44 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.010351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4300  hypothetical protein  52.11 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.486279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3777  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2473  hypothetical protein  38 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121534  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  40.38 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2774  hypothetical protein  36.36 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214671 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  39.66 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  27.5 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  27.5 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  27.5 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  35.48 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  25.3 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2014  hypothetical protein  34.69 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0149983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44430  hypothetical protein  33.9 
 
 		 179 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0337511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3782  hypothetical protein  33.9 
 
 		 179 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0458  hypothetical protein  31.15 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.912732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>