30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET_tRNA-Gln-2 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0667259  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_896  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000031288  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0034  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253342  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0032  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0050  tRNA-Gln  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2742  tRNA-Gln  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000362566  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0045  tRNA-Gln  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515378  hitchhiker  0.000000000930227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0077  tRNA-Gln  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.273765 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0079  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0012  tRNA-Gln  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0269689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0046  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0045  tRNA-Gln  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000500622  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0052  tRNA-Gln  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0049  tRNA-Gln  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0009  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0002  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0427348  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0018  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0024  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0003  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0046  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450062 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0043  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0043  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.613613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0062  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0046  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0053  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0029  tRNA-OTHER  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0074  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000739317  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0072  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000124926  normal  0.0423905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0070  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000111082  normal  0.043537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>