18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3265 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3265  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
133 aa  268  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.165533  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2832  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
133 aa  268  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2407  DNA polymerase beta domain protein region  59.68 
 
 
124 aa  159  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0175  DNA polymerase beta subunit  45.83 
 
 
121 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2754  hypothetical protein  41.24 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604602  hitchhiker  0.000634444 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0416  hypothetical protein  32.99 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0566147 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0282  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3358  hypothetical protein  37.11 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0280  DNA polymerase beta subunit  38.95 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000175333  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3517  DNA polymerase beta subunit  33.64 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.53716  normal  0.909261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1646  DNA polymerase beta domain protein region  38.68 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0702167  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0518  hypothetical protein  35.71 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00471215  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4308  hypothetical protein  30.11 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4369  hypothetical protein  30.11 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2315  DNA polymerase beta domain protein region  36.28 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000759892  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  29.29 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  36.71 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  32.91 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>