53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0736 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0736  50S ribosomal protein L25  100 
 
 		 108 aa  226  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.671529 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0707  50S ribosomal protein L25  95.37 
 
 		 108 aa  216  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4741  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  61.46 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3523  Ribosomal protein L25-like protein  59.57 
 
 		 98 aa  123  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3283  50S ribosomal protein L25  55.1 
 
 		 102 aa  123  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228774  normal  0.044405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2054  50S ribosomal protein L25  56.38 
 
 		 99 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2531  50S ribosomal protein L25  50.98 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1635  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  35.29 
 
 		 205 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0078  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  35.19 
 
 		 208 aa  52.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.514827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2818  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  29 
 
 		 217 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000104  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1803  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  37.5 
 
 		 202 aa  52  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2145  ribosomal protein L25  37.5 
 
 		 202 aa  52  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1041  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  36.54 
 
 		 201 aa  51.2  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000685221  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1074  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  37.97 
 
 		 213 aa  50.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.87719  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1454  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  31.87 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128254  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0673  ribosomal protein L25  31.18 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596696 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1232  ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc)  32.22 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0660333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0911  50S ribosomal protein L25P  33.65 
 
 		 223 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3628  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  36.47 
 
 		 200 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4253  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  35.06 
 
 		 222 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4339  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  35.06 
 
 		 222 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.583679  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1169  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  31.73 
 
 		 204 aa  47.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4632  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  35.06 
 
 		 222 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.570294 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0346  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  34.34 
 
 		 228 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.246778 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1247  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  38.46 
 
 		 200 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000297529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3653  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  30 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00224871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0174  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  32.58 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.118362  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0426  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  32.18 
 
 		 218 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122044  normal  0.150732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1127  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  32.63 
 
 		 203 aa  43.9  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2257  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  26.92 
 
 		 216 aa  42.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0677  50S ribosomal protein L25P  33.33 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4787  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  31.33 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0142  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  30.59 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0727  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  29.76 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912849  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0755  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  34.62 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1255  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  27.47 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0112438  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4754  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  36.25 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0446761  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1939  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  31.17 
 
 		 223 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0896  50S ribosomal protein L25P  34.52 
 
 		 226 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.220682  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0306  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  29.52 
 
 		 194 aa  41.6  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0943  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  29.59 
 
 		 204 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.293242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0047  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  29.29 
 
 		 210 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2415  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  27.66 
 
 		 202 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.203941  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1103  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  35 
 
 		 203 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4539  50S ribosomal protein L25P  29.59 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000207822  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0765  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  33.33 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0523  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  28.05 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.153514  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1377  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  25.77 
 
 		 207 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0448782 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0536  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  28.05 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0706274  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1129  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  27.45 
 
 		 217 aa  40.4  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000048094  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2206  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  24.75 
 
 		 207 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00480053  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0528  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  25.47 
 
 		 212 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4462  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  30.93 
 
 		 198 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>