26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2909 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2909  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
139 aa  287  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298269  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0204  TPR repeat-containing protein  61.31 
 
 
140 aa  191  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4782  TPR repeat-containing protein  58.82 
 
 
140 aa  187  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0910  hypothetical protein  60.29 
 
 
142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.328003 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0422  hypothetical protein  58.09 
 
 
141 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0411  TPR repeat-containing protein  58.09 
 
 
141 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1288  TPR repeat-containing protein  56.62 
 
 
141 aa  174  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.806395 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01911  hypothetical protein  48.89 
 
 
139 aa  150  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.775534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1486  hypothetical protein  48.89 
 
 
139 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.952228  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26241  hypothetical protein  50.75 
 
 
139 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.49947 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01331  hypothetical protein  49.24 
 
 
139 aa  147  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0474344  normal  0.486944 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2358  hypothetical protein  47.73 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0333  hypothetical protein  44.78 
 
 
139 aa  140  7e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3950  TPR repeat-containing protein  51.09 
 
 
140 aa  136  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174143  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01351  hypothetical protein  41.91 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01341  hypothetical protein  41.91 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.442457  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01311  hypothetical protein  40.44 
 
 
142 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0120  hypothetical protein  39.71 
 
 
142 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 
393 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
374 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.57 
 
 
340 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 
634 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
200 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1535  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.37 
 
 
251 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.500528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
934 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
923 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>