36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2018 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 
231 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  64.41 
 
 
227 aa  278  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  41.82 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  34.75 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  34.75 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  39.81 
 
 
238 aa  79  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  36.52 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  36.84 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  38.68 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  39.64 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  38.46 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  34.51 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  32.14 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  38.05 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  39.6 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  30 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  33.62 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  32.65 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  32.65 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  29.82 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  34.86 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  31.07 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  29.35 
 
 
102 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  25.89 
 
 
214 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  21.6 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19221  hypothetical protein  24.22 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  23.96 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1179  Ion transport 2  43.1 
 
 
147 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00343894  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  25 
 
 
262 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  24.35 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  28.57 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  27.47 
 
 
302 aa  42.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0175  Ion transport 2 domain-containing protein  32.53 
 
 
290 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.733026  normal  0.37729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0195  Ion transport 2 domain-containing protein  32.53 
 
 
311 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0186  Ion transport 2  32.53 
 
 
311 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.877923  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  28.45 
 
 
235 aa  41.6  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.724435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>