19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0175 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0175  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 121 aa  245  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3265  DNA polymerase beta domain protein region  44.64 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.165533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2832  DNA polymerase beta domain protein region  44.64 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2407  DNA polymerase beta domain protein region  46.08 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3517  DNA polymerase beta subunit  35.04 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.53716  normal  0.909261 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0282  DNA polymerase beta subunit  32.17 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2754  hypothetical protein  29.9 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604602  hitchhiker  0.000634444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4308  hypothetical protein  34.07 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0416  hypothetical protein  31.96 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0566147 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0280  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000175333  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3358  hypothetical protein  29.17 
 
 		 265 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4369  hypothetical protein  32.97 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2315  DNA polymerase beta domain protein region  32.5 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000759892  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1646  DNA polymerase beta domain protein region  35.09 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0702167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2319  DNA polymerase, beta-like region  35.29 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000830496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0518  hypothetical protein  26.56 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00471215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0600  hypothetical protein  34.94 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.887061 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4093  DNA polymerase beta subunit  35.96 
 
 		 144 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.792908  normal  0.694143 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2250  DNA polymerase beta subunit  30.23 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>