More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2536 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2536  sulfate adenylyltransferase subunit 2  100 
 
 		 293 aa  611  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4112  sulfate adenylyltransferase subunit 2  85.32 
 
 		 293 aa  532  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1560  sulfate adenylyltransferase subunit 2  75.43 
 
 		 293 aa  480  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.342351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6448  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.24 
 
 		 286 aa  407  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3830  sulfate adenylyltransferase subunit 2  60.41 
 
 		 265 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0104851  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1193  sulfate adenylyltransferase subunit 2  58.7 
 
 		 266 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1717  sulfate adenylyltransferase subunit 2  56.16 
 
 		 267 aa  328  7e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3063  sulfate adenylyltransferase subunit 2  50.17 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6983  sulfate adenylyltransferase subunit 2  48.12 
 
 		 274 aa  271  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1630  sulfate adenylyltransferase subunit 2  47.28 
 
 		 268 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000248691  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2763  sulfate adenylyltransferase subunit 2  48.81 
 
 		 268 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4016  sulfate adenylyltransferase subunit 2  47.44 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.274422  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3563  sulfate adenylyltransferase subunit 2  48.46 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1154  sulfate adenylyltransferase subunit 2  47.1 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1043  sulfate adenylyltransferase subunit 2  47.44 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3127  sulfate adenylyltransferase subunit 2  46.42 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.360579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1399  sulfate adenylyltransferase subunit 2  46.08 
 
 		 264 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0823  sulfate adenylyltransferase subunit 2  47.44 
 
 		 289 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168888  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0828  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40.81 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2137  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.25 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0420  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.63 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00766  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.44 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001707  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.44 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2891  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.32 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1261  sulfate adenylyltransferase subunit 2  40 
 
 		 315 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1686  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.81 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1318  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.62 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.237649  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0157  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.82 
 
 		 303 aa  205  6e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0142128  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0071  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.5 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0831  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.13 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2182  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.25 
 
 		 301 aa  205  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2553  sulfate adenylyltransferase subunit 2  39.81 
 
 		 303 aa  205  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3072  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.7 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0900  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.7 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0863  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.7 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0997693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2142  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.82 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0113655  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1752  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.2 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3727  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.08 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12970  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.34 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0796  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.89 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221596 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0928  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.7 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1497  sulfate adenylyltransferase, small subunit  39.38 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3408  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.7 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0962  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.7 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0954  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.7 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3043  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.7 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5015  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.04 
 
 		 305 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57720  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.04 
 
 		 305 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0558  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.32 
 
 		 317 aa  202  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0328  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.2 
 
 		 322 aa  202  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1120  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.32 
 
 		 316 aa  202  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0862  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.82 
 
 		 302 aa  202  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0877  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.12 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1757  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.51 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2344  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.82 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2734  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.82 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0448495  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1303  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.12 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4433  sulfate adenylate transferase, subunit 2  37.12 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4128  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.12 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3223  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.51 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1531  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.89 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2145  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.2 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4546  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.12 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4422  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.12 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0663  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.2 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0910  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.12 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0873034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0818  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.51 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.90537 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1017  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.56 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0890  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.73 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0214  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.58 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0959  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.84 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.70821  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1422  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.81 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  hitchhiker  0.00577944 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3187  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.58 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3436  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.39 
 
 		 302 aa  198  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0969  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.39 
 
 		 302 aa  198  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3304  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.39 
 
 		 302 aa  198  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1769  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.39 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000131984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2890  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.2 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4004  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.2 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1299  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.08 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.583086  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02602  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.2 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0936  sulfate adenylyltransferase, small subunit  38.2 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02567  hypothetical protein  38.2 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0960  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.2 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3053  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.2 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305816  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2451  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.88 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2878  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.2 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2289  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.08 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1686  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.81 
 
 		 301 aa  195  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3086  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.2 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1651  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.12 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2624  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.44 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3125  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.2 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.282658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2961  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.27 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.889304 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2353  sulfate adenylyltransferase subunit 2  36.34 
 
 		 304 aa  193  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.295383  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3141  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.2 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.431784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3060  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.2 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3245  sulfate adenylyltransferase subunit 2  38.2 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1779  sulfate adenylyltransferase subunit 2  34.8 
 
 		 302 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2629  sulfate adenylyltransferase subunit 2  37.58 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>