More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2442 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2442  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 494 aa  1022    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0259159  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  44.86 
 
 		 513 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  42.62 
 
 		 499 aa  443  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  43.5 
 
 		 503 aa  443  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  44.06 
 
 		 520 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  43 
 
 		 504 aa  438  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  43.64 
 
 		 496 aa  436  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  42.18 
 
 		 498 aa  435  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  43.64 
 
 		 496 aa  437  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  42.18 
 
 		 498 aa  435  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  41.72 
 
 		 496 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  41.72 
 
 		 496 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  42.54 
 
 		 498 aa  429  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  43.09 
 
 		 500 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002675  glycerol kinase  41.77 
 
 		 505 aa  425  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  41.9 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  43.24 
 
 		 496 aa  425  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  41.51 
 
 		 496 aa  428  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  41.51 
 
 		 496 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  40.74 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  41.26 
 
 		 501 aa  426  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  40.98 
 
 		 496 aa  425  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  43.42 
 
 		 489 aa  426  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  43.09 
 
 		 500 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  42.13 
 
 		 498 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  41.51 
 
 		 496 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  41.31 
 
 		 496 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  43.09 
 
 		 500 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  41.51 
 
 		 496 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  41.31 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  42.18 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  42.34 
 
 		 498 aa  425  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  42.42 
 
 		 495 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  42.65 
 
 		 497 aa  428  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  40.77 
 
 		 502 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  40.77 
 
 		 502 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  42.89 
 
 		 499 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  40.77 
 
 		 502 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  40.77 
 
 		 502 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  42.89 
 
 		 503 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  42.48 
 
 		 499 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  40.77 
 
 		 502 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  40.77 
 
 		 502 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  42.89 
 
 		 503 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  42.89 
 
 		 500 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  41.14 
 
 		 496 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  40.77 
 
 		 502 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  40.77 
 
 		 502 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  41.96 
 
 		 493 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2595  glycerol kinase  45.05 
 
 		 498 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  42.89 
 
 		 518 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  42.68 
 
 		 500 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  40.77 
 
 		 502 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  42.89 
 
 		 518 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  42.89 
 
 		 518 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  42.89 
 
 		 518 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  42.89 
 
 		 518 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  43.14 
 
 		 510 aa  420  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  41.02 
 
 		 494 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  42.36 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  42.48 
 
 		 500 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  42.48 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  41.01 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  40.74 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  41.43 
 
 		 494 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  43.09 
 
 		 500 aa  422  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  44.02 
 
 		 494 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  42.39 
 
 		 498 aa  417  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  41.02 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  41.02 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  40.37 
 
 		 502 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  41.07 
 
 		 496 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  41.02 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  41.31 
 
 		 501 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  42.71 
 
 		 497 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  42.22 
 
 		 507 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  41.98 
 
 		 507 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  40.37 
 
 		 502 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  41.77 
 
 		 503 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  40.37 
 
 		 502 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  41.98 
 
 		 507 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  41.22 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  42.39 
 
 		 494 aa  415  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  41.22 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  40.37 
 
 		 502 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  40.37 
 
 		 502 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  41.22 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3168  glycerol kinase  41.27 
 
 		 507 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  41.63 
 
 		 501 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  41.98 
 
 		 507 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  40.37 
 
 		 502 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  41.02 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  41.15 
 
 		 502 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3608  glycerol kinase  40.66 
 
 		 492 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  40.33 
 
 		 497 aa  415  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  41.53 
 
 		 503 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  40.49 
 
 		 507 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  40.57 
 
 		 505 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08090  glycerol kinase  41.82 
 
 		 499 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000058898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  40.57 
 
 		 496 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>