36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2050 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2050  CRISPR-associated Csm3 family protein  100 
 
 		 279 aa  574  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0985  protein of unknown function DUF324  33.33 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1288  CRISPR-associated Csm3 family protein  34.73 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0685165  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1800  hypothetical protein  32.03 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2392  hypothetical protein  32.13 
 
 		 338 aa  109  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.556583  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  30.9 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5587  protein of unknown function DUF324  28.8 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  28.7 
 
 		 280 aa  99.4  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  31.8 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1443  hypothetical protein  30.45 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0712178 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  29.61 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  28.57 
 
 		 597 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1859  hypothetical protein  28.22 
 
 		 594 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3292  hypothetical protein  24.83 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.798448 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1161  CRISPR-associated Csx7 family protein  32.04 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.59336  hitchhiker  0.00757758 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  28.44 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  28.45 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  23.51 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  22.59 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1287  CRISPR-associated Csm3 family protein  26.51 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.609283  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20530  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  26.14 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0364  hypothetical protein  22.71 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389442 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0187  hypothetical protein  23.62 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1804  hypothetical protein  25.6 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1160  CRISPR-associated Csx7 family protein  27.6 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal  0.0434649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1445  hypothetical protein  25.68 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  25.45 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0158  hypothetical protein  30.17 
 
 		 390 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.59719 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1293  hypothetical protein  23.57 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  25 
 
 		 429 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1834  hypothetical protein  27.43 
 
 		 472 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1162  hypothetical protein  33.64 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00757758 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5588  protein of unknown function DUF324  25.53 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1081  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  26.69 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0192235  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0744  hypothetical protein  27.27 
 
 		 219 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0162344  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0184  hypothetical protein  21.71 
 
 		 548 aa  42.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>