27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0425 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0425  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  163  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0753  hypothetical protein  63.29 
 
 		 79 aa  108  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000530744 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0093  hypothetical protein  53.16 
 
 		 80 aa  97.1  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0431  hypothetical protein  41.25 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0837  hypothetical protein  44.16 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00554204  hitchhiker  0.000686175 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0319  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  47.89 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3462  hypothetical protein  41.56 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00193289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1314  hypothetical protein  48.75 
 
 		 75 aa  70.1  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000587692  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2301  hypothetical protein  38.27 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.962162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4049  hypothetical protein  35.62 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1372  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  47.3 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02080  hypothetical protein  38.96 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  40.91 
 
 		 659 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0495  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  42.5 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  35.8 
 
 		 666 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  36.25 
 
 		 667 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  37.29 
 
 		 645 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  37.29 
 
 		 645 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  34.43 
 
 		 666 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  37.93 
 
 		 653 aa  47.8  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1832  hypothetical protein  35 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0324574  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0086  hypothetical protein  33.33 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2452  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  32.43 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  28.95 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3657  hypothetical protein  32.43 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1845  hypothetical protein  26.92 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>