30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0554 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0554  SlyX  100 
 
 		 78 aa  152  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  44.87 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  42.11 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  40.79 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  40.85 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  42.25 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  38.16 
 
 		 71 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2515  SlyX family protein  37.18 
 
 		 71 aa  50.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3168  SlyX family protein  37.18 
 
 		 71 aa  50.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1341  SlyX  35.21 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18660  hypothetical protein  39.68 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51850  hypothetical protein  38.57 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120935  hitchhiker  0.00317076 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2999  hypothetical protein  38.46 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1564  SlyX family protein  37.66 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4548  hypothetical protein  37.14 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5924  hypothetical protein  36.11 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5298  SlyX family protein  41.43 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.629144  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1786  SlyX family protein  39.44 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1419  SlyX  37.84 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3765  hypothetical protein  35.44 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104944  hitchhiker  0.00334297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1260  SlyX family protein  30.77 
 
 		 70 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3105  SlyX family protein  38.57 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343313  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4022  hypothetical protein  30.77 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1402  hypothetical protein  34.38 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.591267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0103  SlyX  40 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5248  hypothetical protein  41.67 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.687803  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3985  hypothetical protein  32.81 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149872  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1200  hypothetical protein  37.18 
 
 		 71 aa  40  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2122  SlyX family protein  36.62 
 
 		 75 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3842  hypothetical protein  29.49 
 
 		 72 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>