17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6058 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6058  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  796    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0207  hypothetical protein  34.63 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.835179  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3470  hypothetical protein  31.04 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.250629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3458  hypothetical protein  31.62 
 
 		 383 aa  182  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0026  hypothetical protein  28.33 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1332  hypothetical protein  28.35 
 
 		 383 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3625  hypothetical protein  29.53 
 
 		 383 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5967  hypothetical protein  27.74 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0353378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2459  adenylate cyclase protein  27.35 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2176  adenylate cyclase protein  27.07 
 
 		 346 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128241  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7113  hypothetical protein  26.96 
 
 		 408 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.130912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4597  hypothetical protein  26.97 
 
 		 393 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4039  adenylate cyclase protein  27.27 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1673  hypothetical protein  25.75 
 
 		 383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1886  hypothetical protein  28.18 
 
 		 387 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0162  hypothetical protein  27.12 
 
 		 393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451618  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4588  hypothetical protein  26.09 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.597366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>