13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3559 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3559  hypothetical protein  100 
 
 		 647 aa  1340    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0381458  normal  0.0286784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  38.74 
 
 		 1440 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.69 
 
 		 758 aa  50.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1138 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 792 aa  47.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 		 3301 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 3172 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  25.15 
 
 		 573 aa  46.2  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 279 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 448 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  22.36 
 
 		 832 aa  44.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 		 1737 aa  44.3  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.37 
 
 		 1694 aa  43.9  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>