100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1931 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1931  CsbD family protein  100 
 
 		 61 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.403244 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5651  CsbD family protein  69.23 
 
 		 65 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2319  CsbD family protein  62.07 
 
 		 61 aa  81.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1851  CsbD family protein  62.07 
 
 		 61 aa  76.6  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0156  hypothetical protein  52.83 
 
 		 67 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.232255  hitchhiker  0.0000211903 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0166  CsbD-like  52.83 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2503  CsbD-like  49.06 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0483582  normal  0.747917 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  53.57 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08871  CsbD-like protein  44.64 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.919038  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0316  CsbD family protein  46.3 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.179189  hitchhiker  0.0000000572285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  50 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  48.21 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5157  CsbD family protein  45.76 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.461612 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5243  CsbD family protein  44.07 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3411  CsbD family protein  44.07 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62680  hypothetical protein  48.08 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5455  hypothetical protein  48.08 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21937  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3468  CsbD family protein  47.46 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4053  CsbD family protein  47.46 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1175  CsbD-like  43.4 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.577345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3602  CsbD family protein  47.17 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3610  CsbD family protein  48.94 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0252527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4507  putative stress-response protein  40 
 
 		 69 aa  52  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1771  CsbD family protein  42.37 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0249  putative stress-response protein  44.64 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.430539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2683  hypothetical protein  44.07 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03917  predicted stress response protein  41.07 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4285  putative stress-response protein  41.07 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0055  CsbD family protein  44.23 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587208 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3983  putative stress-response protein  41.07 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216116 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4598  putative stress-response protein  41.07 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4552  putative stress-response protein  41.07 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  42.86 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5526  putative stress-response protein  41.07 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.289766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03877  hypothetical protein  41.07 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3948  CsbD family protein  41.07 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4634  putative stress-response protein  41.07 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.27716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4583  putative stress-response protein  41.07 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.808019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4582  putative stress-response protein  41.07 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4432  putative stress-response protein  41.07 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000026393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4497  putative stress-response protein  41.07 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0312  CsbD family protein  43.33 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2910  hypothetical protein  41.67 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.912456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7336  CsbD family protein  40.74 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1731  CsbD-like  42.59 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.888491  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0418  protein of unknown function DUF883 ElaB  36.84 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.992162  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02853  hypothetical protein  48.08 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4458  putative stress-response protein  38.33 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  40 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0249  CsbD family protein  41.67 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.806241  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  40 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0515  putative stress-response protein  36.67 
 
 		 69 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2288  CsbD family protein  42.86 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4154  CsbD-like  42.86 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0254  CsbD family protein  41.67 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0514063 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4727  CsbD family protein  43.1 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  hitchhiker  0.00687348 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1037  CsbD-like protein  42.11 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.450936  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3988  CsbD-like  42.86 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1152  CsbD-like  40 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0795  CsbD family protein  38.89 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2250  hypothetical protein  43.75 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1645  CsbD family protein  41.07 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224689  normal  0.344043 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2202  CsbD-like  38.46 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0848  CsbD family protein  45.65 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00395156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1847  CsbD family protein  44.44 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0369  CsbD family protein  41.38 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0852  CsbD family protein  40.68 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0240  CsbD family protein  38.89 
 
 		 73 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.9917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  38.89 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  37.5 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  35 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0799  hypothetical protein  36.84 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.247358 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3505  CsbD-like  36.54 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00399435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1698  CsbD family protein  40.74 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2245  CsbD-like protein  39.29 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4008  CsbD-like  33.33 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0235729  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1092  hypothetical protein  41.3 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1374  CsbD-like  37.04 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2262  CsbD family protein  40.35 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.860427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2491  CsbD family protein  38.89 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.853638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1391  CsbD family protein  37.74 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  38.33 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6641  CsbD family protein  38.46 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000497108 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  37.74 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0554  hypothetical protein  37.04 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0655  hypothetical protein  37.04 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.438362 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0456  hypothetical protein  37.04 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.503316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  38.18 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2699  CsbD family protein  35.29 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.90696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  32.76 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  32.76 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  37.04 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  38.18 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2892  CsbD family protein  41.86 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327354  normal  0.0609409 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6005  hypothetical protein  39.62 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  36.54 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  36.54 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1270  hypothetical protein  35.29 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.390747  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2928  CsbD family protein  35.29 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3555  hypothetical protein  30.19 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000794392  normal  0.0690948 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>