74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0554 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0554  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0456  hypothetical protein  98.39 
 
 		 62 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.503316  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3463  hypothetical protein  67.74 
 
 		 62 aa  87.8  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0655  hypothetical protein  61.67 
 
 		 61 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.438362 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3584  hypothetical protein  54.84 
 
 		 63 aa  73.9  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4053  CsbD family protein  42.11 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5157  CsbD family protein  43.86 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.461612 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02853  hypothetical protein  43.94 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3468  CsbD family protein  42.11 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3411  CsbD family protein  42.11 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5243  CsbD family protein  42.11 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3602  CsbD family protein  45.61 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1092  hypothetical protein  42.11 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0055  CsbD family protein  47.37 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587208 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0316  CsbD family protein  43.86 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.179189  hitchhiker  0.0000000572285 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2503  CsbD-like  40.35 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0483582  normal  0.747917 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0240  CsbD family protein  45.61 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.9917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2683  hypothetical protein  40.35 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0848  CsbD family protein  42.11 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00395156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5455  hypothetical protein  43.86 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62680  hypothetical protein  43.86 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1731  CsbD-like  43.86 
 
 		 65 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.888491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  40.35 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3610  CsbD family protein  45 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0252527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  45.61 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0156  hypothetical protein  42.11 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.232255  hitchhiker  0.0000211903 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0166  CsbD-like  42.11 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  38.18 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1374  CsbD-like  43.86 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2491  CsbD family protein  40 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.853638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0515  putative stress-response protein  41.94 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6641  CsbD family protein  42.11 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000497108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2892  CsbD family protein  44.9 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327354  normal  0.0609409 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  35.09 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2250  hypothetical protein  38.6 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  35.09 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1575  CsbD-like  40.35 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0249  putative stress-response protein  38.6 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.430539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4432  putative stress-response protein  38.6 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000026393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4497  putative stress-response protein  38.6 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4552  putative stress-response protein  38.6 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5526  putative stress-response protein  38.6 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.289766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4582  putative stress-response protein  38.6 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4583  putative stress-response protein  38.6 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.808019 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4634  putative stress-response protein  38.6 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.27716 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3983  putative stress-response protein  38.6 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216116 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4598  putative stress-response protein  38.6 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4285  putative stress-response protein  38.6 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03877  hypothetical protein  38.6 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1391  CsbD family protein  38.6 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03917  predicted stress response protein  38.6 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3948  CsbD family protein  38.6 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4507  putative stress-response protein  38.6 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  40.35 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0249  CsbD family protein  42.31 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.806241  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1931  CsbD family protein  37.04 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.403244 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08871  CsbD-like protein  40.35 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.919038  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0254  CsbD family protein  42.31 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0514063 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  40.35 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  38.6 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  40.35 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4458  putative stress-response protein  38.6 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1771  CsbD family protein  35.09 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  38.6 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  40.35 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5651  CsbD family protein  42.31 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3505  CsbD-like  36.84 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00399435  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  40.35 
 
 		 68 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7336  CsbD family protein  40.35 
 
 		 67 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2910  hypothetical protein  38.6 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.912456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2319  CsbD family protein  35.85 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6005  hypothetical protein  40.35 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4008  CsbD-like  35.09 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0235729  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2202  CsbD-like  36.84 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>