14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1054 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1054  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240358 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1382  hypothetical protein  50.77 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  34.09 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  38.89 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  42.62 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  34.67 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3152  hypothetical protein  38.89 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0152929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  43.64 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  43.64 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  31.25 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  27.91 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  29.21 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  24.14 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>