23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1708 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1708  hypothetical protein  100 
 
 		 1081 aa  2227    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.56127  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0447  hypothetical protein  31.12 
 
 		 1062 aa  449  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.787096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4212  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1082 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3013  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.8 
 
 		 444 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0395  hypothetical protein  24.17 
 
 		 626 aa  53.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.771372  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1463  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.75 
 
 		 422 aa  53.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2838  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.75 
 
 		 422 aa  53.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2375  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.75 
 
 		 422 aa  53.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1922  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.75 
 
 		 422 aa  53.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1878  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.75 
 
 		 422 aa  53.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal  0.561944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1618  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.75 
 
 		 422 aa  53.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000636906  hitchhiker  0.000000000000550097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1455  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.75 
 
 		 422 aa  53.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.170778  normal  0.343243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0975  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.75 
 
 		 422 aa  53.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.171918  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0697  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.75 
 
 		 422 aa  53.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2550  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.75 
 
 		 422 aa  52.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0006691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2677  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30 
 
 		 447 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2751  hypothetical protein  21.53 
 
 		 1301 aa  49.7  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2066  group II intron reverse transcriptase/maturase  30.91 
 
 		 404 aa  48.9  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1485  putative reverse transcriptase/maturase family protein  29.73 
 
 		 256 aa  47.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  29.13 
 
 		 731 aa  45.8  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1310  RNA-directed DNA polymerase  25.81 
 
 		 428 aa  45.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2189  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.77 
 
 		 343 aa  45.1  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134811  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5840  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.83 
 
 		 309 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>