15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1150 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1150  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1417  hypothetical protein  57.53 
 
 
259 aa  317  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0262  hypothetical protein  53.94 
 
 
266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0714  hypothetical protein  50.39 
 
 
286 aa  262  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0513  hypothetical protein  50.39 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.891131  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3348  hypothetical protein  48.44 
 
 
260 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0067  hypothetical protein  40.47 
 
 
261 aa  198  9e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4887  hypothetical protein  35.38 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0645  hypothetical protein  56.31 
 
 
164 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.881182  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4514  hypothetical protein  28.81 
 
 
286 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0969  hypothetical protein  37.36 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3119  hypothetical protein  24.71 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4909  transcriptional regulator protein-like protein  25.93 
 
 
276 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4390  transcriptional regulator-like protein  23.68 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2938  hypothetical protein  23.33 
 
 
277 aa  42  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.214204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>