More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0740 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  80.43 
 
 		 460 aa  788    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2617  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  66.16 
 
 		 458 aa  652    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  88.24 
 
 		 459 aa  857    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  88.24 
 
 		 485 aa  856    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  87.39 
 
 		 460 aa  855    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  80.22 
 
 		 460 aa  786    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  88.89 
 
 		 459 aa  868    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1015  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  66.45 
 
 		 458 aa  660    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  100 
 
 		 459 aa  952    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0838  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  67.97 
 
 		 458 aa  664    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  63.77 
 
 		 461 aa  627  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3094  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  58.66 
 
 		 461 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  58.37 
 
 		 461 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  58.12 
 
 		 463 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  56.21 
 
 		 455 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  55.3 
 
 		 455 aa  524  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  48.25 
 
 		 456 aa  455  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  41.35 
 
 		 512 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4461  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  41.7 
 
 		 518 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1051  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  42.26 
 
 		 472 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5099  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  41.39 
 
 		 519 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0971  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  41.18 
 
 		 519 aa  359  7e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1075  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.96 
 
 		 537 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.902597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.86 
 
 		 512 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.97 
 
 		 518 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1520  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  39.69 
 
 		 519 aa  356  5e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.268449  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1238  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.69 
 
 		 519 aa  356  5e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3994  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.32 
 
 		 512 aa  353  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.18 
 
 		 511 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.53 
 
 		 518 aa  352  7e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0090  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.83 
 
 		 519 aa  350  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5923  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain, nifK  39.78 
 
 		 519 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.77 
 
 		 511 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.77 
 
 		 511 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.96 
 
 		 523 aa  349  6e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4932  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.24 
 
 		 510 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0475  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.83 
 
 		 520 aa  345  7e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3630  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.3 
 
 		 519 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154092 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1352  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit beta  40 
 
 		 511 aa  343  2.9999999999999997e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475929  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6223  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.56 
 
 		 513 aa  343  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0231  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.81 
 
 		 519 aa  342  7e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3536  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.24 
 
 		 512 aa  342  9e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.64 
 
 		 511 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1607  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.78 
 
 		 519 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262136  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  39.22 
 
 		 458 aa  340  4e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2100  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.97 
 
 		 487 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.02 
 
 		 489 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0539  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.91 
 
 		 506 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  40.22 
 
 		 458 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.91 
 
 		 516 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1568  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.01 
 
 		 511 aa  337  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.511918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5054  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.29 
 
 		 513 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4138  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.44 
 
 		 512 aa  335  9e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1467  nitrogenase, molybdenum-iron protein beta chain(NifK)  37.75 
 
 		 519 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261912  hitchhiker  0.00055229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  39.46 
 
 		 475 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1200  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.04 
 
 		 524 aa  333  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1012  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.88 
 
 		 510 aa  333  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245367  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1413  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.72 
 
 		 522 aa  331  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.99 
 
 		 487 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  39.68 
 
 		 458 aa  330  3e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  37.01 
 
 		 489 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.75 
 
 		 489 aa  329  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.24 
 
 		 506 aa  329  6e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  38.96 
 
 		 458 aa  329  8e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.64 
 
 		 523 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.64 
 
 		 519 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.77 
 
 		 487 aa  327  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.88 
 
 		 489 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0493  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.99 
 
 		 522 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.34 
 
 		 489 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2343  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.33 
 
 		 519 aa  325  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  38.41 
 
 		 462 aa  324  2e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1432  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.44 
 
 		 519 aa  323  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  39.59 
 
 		 475 aa  323  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.71 
 
 		 487 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3469  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.77 
 
 		 487 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  38.43 
 
 		 490 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  36.47 
 
 		 462 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  35.79 
 
 		 462 aa  306  6e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  36.02 
 
 		 462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  35.71 
 
 		 477 aa  294  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  36.78 
 
 		 451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1757  Nitrogenase  36.73 
 
 		 457 aa  282  9e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0799606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  35.4 
 
 		 472 aa  281  2e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  35.15 
 
 		 461 aa  276  5e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1955  Nitrogenase  34.97 
 
 		 450 aa  275  9e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171503  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0842  Nitrogenase  34.3 
 
 		 450 aa  275  9e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1633  Nitrogenase  35.78 
 
 		 456 aa  272  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000322358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  36.89 
 
 		 462 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0679  Nitrogenase  34.52 
 
 		 451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0432483  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1250  nitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein NifN, putative  34.47 
 
 		 452 aa  266  8e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113259  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4681  nitrogenase  37.36 
 
 		 462 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0738  nitrogenase  35.91 
 
 		 450 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1551  nitrogenase, subunit K  34.65 
 
 		 462 aa  256  8e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1392  nitrogenase  36.63 
 
 		 462 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392625  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1620  Fe-only nitrogenase, beta subunit  35.87 
 
 		 461 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.855819  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1534  nitrogenase  33.94 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.898228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  30.11 
 
 		 479 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2621  Nitrogenase  31.66 
 
 		 538 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1029  Nitrogenase  32.65 
 
 		 466 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>