18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1640 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1640  protein of unknown function DUF55  100 
 
 		 150 aa  316  7.999999999999999e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1260  protein of unknown function DUF55  54.26 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4221  hypothetical protein  46.48 
 
 		 149 aa  146  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0064  hypothetical protein  48.12 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0055  hypothetical protein  50.37 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0368538  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0064  hypothetical protein  50.37 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.707709  normal  0.0479663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0045  hypothetical protein  50.37 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.0170857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0785  hypothetical protein  48.48 
 
 		 141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5979  hypothetical protein  45.52 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211004  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0106  hypothetical protein  48.87 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0530  hypothetical protein  43.8 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3079  protein of unknown function DUF55  42.86 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1825  protein of unknown function DUF55  43.45 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1668  protein of unknown function DUF55  40.96 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2002  hypothetical protein  40.96 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.902654  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0346  protein of unknown function DUF55  31.13 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.309429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0637  hypothetical protein  28.18 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1512  hypothetical protein  28.97 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>