15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1349 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1349  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  1013    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1599  Arylsulfotransferase  25.31 
 
 
562 aa  77  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  25.07 
 
 
915 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1927  hypothetical protein  26.35 
 
 
422 aa  68.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  24.27 
 
 
618 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1756  hypothetical protein  24.79 
 
 
614 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  20.44 
 
 
514 aa  64.7  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4647  hypothetical protein  26.69 
 
 
397 aa  55.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  24.52 
 
 
439 aa  50.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02186  conserved hypothetical protein  22.51 
 
 
572 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354311  normal  0.214267 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  22.78 
 
 
1022 aa  48.5  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01160  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 
568 aa  47.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  21.65 
 
 
371 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  24.18 
 
 
374 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  21.1 
 
 
374 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>