153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0757 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0757  phosphate transporter  100 
 
 
344 aa  685    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000549606  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1958  phosphate transporter  29.52 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.937918  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1034  phosphate transporter  30.87 
 
 
402 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0659883  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0100  phosphate transporter  28.62 
 
 
394 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2328  phosphate transporter  26.6 
 
 
391 aa  106  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0102  phosphate transporter  27.94 
 
 
392 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1653  phosphate transporter  26.02 
 
 
388 aa  96.7  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.217957 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0277  phosphate transporter  28.57 
 
 
392 aa  92.8  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0857  phosphate transporter  31.02 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3255  phosphate transporter  28.3 
 
 
414 aa  90.1  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.222052  decreased coverage  0.00950804 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0789  phosphate transporter  26.2 
 
 
308 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1733  phosphate transporter  25 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.801901  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0286  phosphate transporter  27.49 
 
 
310 aa  79  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.612089  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0726  phosphate transporter  27.3 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000419636  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0010  phosphate transporter  29.23 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0010  phosphate transporter  29.62 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0884  phosphate transporter  24.53 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1333  phosphate transporter  27.53 
 
 
520 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383309  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2034  phosphate transporter  30.99 
 
 
498 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0665  phosphate transporter  31.25 
 
 
494 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393628  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0872  phosphate transporter  26.13 
 
 
312 aa  64.3  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.152415  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2045  phosphate transporter  24.58 
 
 
346 aa  62.8  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000973225  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2323  phosphate transporter  26.54 
 
 
504 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0542  phosphate transporter  28.65 
 
 
542 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004529  probable low-affinity inorganic phosphate transporter  23.56 
 
 
419 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000555877  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03147  Phosphate permease  29.3 
 
 
423 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0428562  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1922  phosphate transporter  25.28 
 
 
397 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00186941  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1191  phosphate permease  26.13 
 
 
420 aa  60.8  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3279  phosphate transporter  28.03 
 
 
524 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.854272 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0503  phosphate transporter  29.94 
 
 
549 aa  60.5  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2170  inorganic phosphate transporter  26.54 
 
 
505 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0842  phosphate transporter  26.54 
 
 
505 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0133767  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3885  phosphate transporter  22.62 
 
 
347 aa  59.7  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3319  phosphate transporter  21.93 
 
 
422 aa  59.7  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1670  phosphate transporter  28.32 
 
 
526 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0543  phosphate transporter  30.59 
 
 
523 aa  58.9  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2020  pho4 family protein  24.18 
 
 
433 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0151  phosphate transporter  24.69 
 
 
303 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0370  phosphate transporter  24.48 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000205571  unclonable  0.0000000000610826 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0129  phosphate transporter  23.67 
 
 
338 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0906  phosphate transporter  28.1 
 
 
429 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3456  phosphate transporter  28.1 
 
 
429 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000664139  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0882  phosphate transporter  28.1 
 
 
429 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102978  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0916  phosphate transporter  28.1 
 
 
429 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000785121  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5782  phosphate permease  27.07 
 
 
500 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0900  phosphate transporter  24.85 
 
 
502 aa  57  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.177688 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3637  phosphate transporter family protein  29.68 
 
 
431 aa  56.2  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3586  phosphate transporter  33.57 
 
 
521 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2385  phosphate transporter  25.61 
 
 
332 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2217  phosphate transporter  24.6 
 
 
427 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0633  hypothetical protein  26.63 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0617  hypothetical protein  26.63 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0716  phosphate transporter  28.78 
 
 
422 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000146128  unclonable  0.000000015476 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3097  phosphate transporter  27.45 
 
 
429 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000238247  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0389  phosphate transporter  26.06 
 
 
501 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.797462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3122  phosphate permease  26.4 
 
 
514 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.669581  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0821  phosphate transporter  26.8 
 
 
429 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.247427 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2674  phosphate transporter  30.28 
 
 
423 aa  53.9  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00487764  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1083  phosphate transporter  24.01 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3120  phosphate transporter  26.8 
 
 
429 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000658965  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0852  phosphate transporter  26.8 
 
 
429 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000695  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0617  phosphate transporter  29.5 
 
 
422 aa  53.5  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080606  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0142  phosphate transporter  29.29 
 
 
418 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.983377  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1237  phosphate transporter  25.39 
 
 
326 aa  53.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0608  phosphate transporter  26.25 
 
 
494 aa  53.5  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0822433  normal  0.70897 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08956  phosphate-repressible phosphate permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01850)  26.7 
 
 
571 aa  53.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0229  phosphate transporter  25.27 
 
 
422 aa  53.1  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3488  phosphate transporter  28.26 
 
 
422 aa  53.1  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000339536  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0043  phosphate transporter  25.83 
 
 
331 aa  52.8  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3844  phosphate transporter  28.99 
 
 
422 aa  52.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000689956  hitchhiker  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3771  phosphate transporter, putative  25.57 
 
 
424 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1850  phosphate transporter  26.06 
 
 
535 aa  52  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0843  phosphate transporter  24.36 
 
 
332 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0687  phosphate transporter  22.48 
 
 
402 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000146825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1527  phosphate transporter  24.37 
 
 
411 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331212  normal  0.0143461 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2682  putative phosphate transporter  29.51 
 
 
428 aa  52.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3131  phosphate transporter  24.44 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00242659  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0566  phosphate transporter  28.68 
 
 
422 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0663  phosphate transporter  22.25 
 
 
402 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143289  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0667  phosphate transporter  31.13 
 
 
496 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0492  phosphate transporter  27.75 
 
 
401 aa  50.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000002295  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00862  hypothetical protein  30.13 
 
 
419 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  25.17 
 
 
336 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0691  phosphate transporter  28.03 
 
 
422 aa  49.3  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000075079  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1748  phosphate transporter  22.7 
 
 
332 aa  49.3  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0493657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0487  phosphate transporter  26.36 
 
 
499 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306964  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4259  phosphate transporter  22.89 
 
 
332 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2117  phosphate transporter  26.24 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1147  phosphate transporter  28.86 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.367938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1646  phosphate transporter  25.2 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0443  phosphate transporter  26.76 
 
 
499 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5952  phosphate transporter  26.76 
 
 
422 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2189  phosphate transporter family protein  26.75 
 
 
417 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68780  phosphate transporter  26.49 
 
 
422 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2275  phosphate transporter  25.19 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265898  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0137  low-affinity inorganic phosphate transporter  26.75 
 
 
417 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  23.55 
 
 
333 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3781  sodium/phosphate symporter  27.12 
 
 
411 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1398  phosphate transporter family protein  24.6 
 
 
336 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1888  phosphate transporter family protein  24.6 
 
 
336 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.527303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>