26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0607 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0607  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 249 aa  506  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.654213  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01650  possible uroporphyrinogen-III synthase  60.08 
 
 		 248 aa  333  1e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0556  uroporphyrinogen III synthase HEM4  60.24 
 
 		 249 aa  332  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0382  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  51.84 
 
 		 256 aa  264  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2913  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  50 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0169  uroporphyrinogen-III synthase  50.4 
 
 		 265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0486  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  47.79 
 
 		 263 aa  243  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.473173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3227  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  46.34 
 
 		 261 aa  239  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0100705  normal  0.638132 
 
 
-
 
NC_002950  PG0202  uroporphyrinogen-III synthase HemD, putative  45.08 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  24.11 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0653  uroporphyrinogen-III synthase  24.11 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4599  uroporphyrinogen-III synthase  24.12 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.11 
 
 		 508 aa  48.9  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0496  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  28.57 
 
 		 552 aa  48.9  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4695  uroporphyrinogen-III synthase  23.08 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4360  uroporphyrinogen-III synthase  23.08 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.578422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4550  uroporphyrinogen-III synthase  23.08 
 
 		 250 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4554  uroporphyrinogen-III synthase  22.12 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0236  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  28.57 
 
 		 528 aa  44.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4207  uroporphyrinogen-III synthase  22.57 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4196  uroporphyrinogen-III synthase  22.12 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  28.47 
 
 		 526 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6129  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.15 
 
 		 604 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143048  normal  0.442264 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  22.68 
 
 		 252 aa  42.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2731  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  33.33 
 
 		 563 aa  42  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.510631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0358  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.15 
 
 		 526 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>