36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0356 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  100 
 
 		 169 aa  328  2e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02100  hypothetical protein  35.57 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  29.24 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  32.64 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  31.94 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  31.25 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  29.86 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  22.81 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  28.31 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0823  hypothetical protein  31.25 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  33.33 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  28.07 
 
 		 186 aa  51.2  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  33.02 
 
 		 178 aa  50.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  27.89 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4049  colicin V production protein  30.33 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.868969  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3696  Colicin V production protein  30.84 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3791  Colicin V production protein  30.84 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  30.36 
 
 		 189 aa  47.8  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4093  colicin V production protein  29.69 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1805  colicin V production protein  26.92 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0256  CvpA family protein  23.13 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  30.69 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4988  Colicin V production protein  26.36 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.011755 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  30.69 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1046  Colicin V production protein  25.81 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  28.93 
 
 		 193 aa  45.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2152  colicin V production protein  26.09 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.925685  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  30.69 
 
 		 187 aa  44.3  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  23.89 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  29.93 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  30.48 
 
 		 171 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0405  colicin V production protein  29.66 
 
 		 236 aa  42  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3405  hypothetical protein  28.32 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  27.7 
 
 		 165 aa  41.2  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  28.18 
 
 		 177 aa  41.2  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0129  membrane protein CvpA, putative  28.97 
 
 		 196 aa  40.8  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.058893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>