26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0463 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0463  hypothetical protein  100 
 
 
818 aa  1630    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.177436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5220  hypothetical protein  26.56 
 
 
723 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840911  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1596  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  28.32 
 
 
778 aa  160  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.85 
 
 
1001 aa  157  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0080  glycoside hydrolase family 42 protein  26.15 
 
 
715 aa  58.5  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0820956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3125  Beta-galactosidase  26.64 
 
 
671 aa  57  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0401597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3325  Beta-galactosidase  27.76 
 
 
671 aa  55.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0011475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5076  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  26.53 
 
 
713 aa  54.3  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2028  Beta-galactosidase  24.4 
 
 
697 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.119513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4585  Beta-galactosidase  25.67 
 
 
660 aa  53.5  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3245  Beta-galactosidase  22.67 
 
 
673 aa  52.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1557  Beta-galactosidase  25.76 
 
 
649 aa  51.6  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2352  Beta-galactosidase  25.13 
 
 
660 aa  51.6  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0870691  normal  0.136979 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1623  Beta-galactosidase  25.76 
 
 
649 aa  51.2  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.015305  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2829  Beta-galactosidase  24.49 
 
 
714 aa  48.9  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130721  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4578  Beta-galactosidase  25.77 
 
 
664 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144299 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5657  Beta-galactosidase  25.26 
 
 
664 aa  48.9  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00663858  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5202  Beta-galactosidase  25.26 
 
 
664 aa  48.9  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856038  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3197  Beta-galactosidase  24.06 
 
 
661 aa  48.5  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271106  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2015  Beta-galactosidase  25.95 
 
 
657 aa  48.5  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000219156  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4931  Beta-galactosidase  26.26 
 
 
663 aa  48.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1764  Beta-galactosidase  26.72 
 
 
686 aa  48.5  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00394177  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2394  Beta-galactosidase  25.26 
 
 
645 aa  48.1  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06640  beta-galactosidase  26.09 
 
 
701 aa  46.6  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639566  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5486  Beta-galactosidase  25.76 
 
 
663 aa  46.2  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.000330975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3830  Beta-galactosidase  25.42 
 
 
632 aa  44.3  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247674  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>