25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1318 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1318  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  665    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.444184  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2433  hypothetical protein  82.53 
 
 		 332 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2104  hypothetical protein  45.12 
 
 		 334 aa  269  5e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0423  hypothetical protein  47.13 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21680  hypothetical protein  43.15 
 
 		 335 aa  265  8e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.2828  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0080  hypothetical protein  41.62 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.723937  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0200  hypothetical protein  43.96 
 
 		 333 aa  232  9e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1844  hypothetical protein  39.77 
 
 		 346 aa  205  8e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2406  hypothetical protein  40.12 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0191  hypothetical protein  36.87 
 
 		 182 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3934  hypothetical protein  36.55 
 
 		 350 aa  119  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0177  hypothetical protein  38.31 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022221 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0114  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0101503  hitchhiker  0.00333564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1569  hypothetical protein  33.33 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4513  hypothetical protein  34.31 
 
 		 324 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3215  hypothetical protein  33.56 
 
 		 379 aa  102  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000550519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2650  hypothetical protein  32.7 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5160  hypothetical protein  29.48 
 
 		 523 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417539  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3440  hypothetical protein  26.72 
 
 		 355 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00117447  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6760  hypothetical protein  27.65 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0257  hypothetical protein  35.74 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  hitchhiker  0.00111717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2993  hypothetical protein  25.27 
 
 		 511 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.300626  normal  0.564635 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0312  hypothetical protein  32.03 
 
 		 594 aa  56.2  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0329  hypothetical protein  34.04 
 
 		 594 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  45.59 
 
 		 496 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>