22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0257 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0257  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  645    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  hitchhiker  0.00111717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4513  hypothetical protein  44.29 
 
 		 324 aa  205  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3215  hypothetical protein  48.54 
 
 		 379 aa  203  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000550519  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0177  hypothetical protein  50.33 
 
 		 345 aa  202  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022221 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3934  hypothetical protein  50.55 
 
 		 350 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1844  hypothetical protein  41.11 
 
 		 346 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2433  hypothetical protein  33.44 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21680  hypothetical protein  32.57 
 
 		 335 aa  96.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.2828  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0080  hypothetical protein  30.3 
 
 		 336 aa  95.9  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.723937  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2406  hypothetical protein  36.02 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2104  hypothetical protein  34.18 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1318  hypothetical protein  35.74 
 
 		 332 aa  95.1  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.444184  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0423  hypothetical protein  33.71 
 
 		 337 aa  92.8  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2650  hypothetical protein  36.24 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1569  hypothetical protein  34.13 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0200  hypothetical protein  30.48 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5160  hypothetical protein  28.62 
 
 		 523 aa  65.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417539  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6760  hypothetical protein  32.61 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0191  hypothetical protein  34.27 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0114  hypothetical protein  35 
 
 		 164 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0101503  hitchhiker  0.00333564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2993  hypothetical protein  25.78 
 
 		 511 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.300626  normal  0.564635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3440  hypothetical protein  25.09 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00117447  normal  0.107215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>