19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2993 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2993  hypothetical protein  100 
 
 		 511 aa  1048    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.300626  normal  0.564635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3440  hypothetical protein  32.87 
 
 		 355 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00117447  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21680  hypothetical protein  26.86 
 
 		 335 aa  83.2  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.2828  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0423  hypothetical protein  26.32 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2104  hypothetical protein  25.69 
 
 		 334 aa  79.3  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1318  hypothetical protein  25.27 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.444184  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1844  hypothetical protein  25.2 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0080  hypothetical protein  24.19 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.723937  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0200  hypothetical protein  25.95 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2433  hypothetical protein  25.27 
 
 		 332 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0329  hypothetical protein  30.57 
 
 		 594 aa  67  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0312  hypothetical protein  29.94 
 
 		 594 aa  66.6  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0114  hypothetical protein  29.73 
 
 		 164 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0101503  hitchhiker  0.00333564 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0177  hypothetical protein  29.45 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022221 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3215  hypothetical protein  29.89 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000550519  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2406  hypothetical protein  23.3 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5160  hypothetical protein  27.7 
 
 		 523 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417539  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4513  hypothetical protein  29.96 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6760  hypothetical protein  25.55 
 
 		 331 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>