34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1002 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 104 aa  213  5.9999999999999996e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0150146  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1300  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  64.65 
 
 		 102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0209  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  54.26 
 
 		 102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2666  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.53 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.518316  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0331  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.13 
 
 		 164 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0303  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  54.74 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0759911 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2665  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.52 
 
 		 100 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1949  hypothetical protein  52.17 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.573256 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1950  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  53.26 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.246705 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0208  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  52.63 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0245  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52 
 
 		 164 aa  100  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.06 
 
 		 100 aa  97.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0370  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  41.76 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.426462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0440  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.57 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1100  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.37 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000269447  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1006  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.37 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0104746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2219  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.05 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000028084  hitchhiker  0.0000143295 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0685  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.37 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.71 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0121  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.65 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0539  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.94 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1417  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.16 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.82 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.548661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3489  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.59 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1935  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.33 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3312  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.31 
 
 		 368 aa  47  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0632  ferredoxin III, nif-specific  33.75 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3208  ferredoxin III, nif-specific  35.37 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2079  ferredoxin III, nif-specific  31.71 
 
 		 87 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2139  ferredoxin III, nif-specific  31.71 
 
 		 87 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480151 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0457  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.33 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.304767  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2540  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.78 
 
 		 424 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3025  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  35.06 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2804  ferredoxin family protein  31.65 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>