30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1496 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1496  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  636    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1809  hypothetical protein  55.83 
 
 		 328 aa  305  9.000000000000001e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1628  hypothetical protein  55.83 
 
 		 328 aa  305  9.000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0502575  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1997  hypothetical protein  55.21 
 
 		 328 aa  301  7.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0794  SpoOJ regulator  39.88 
 
 		 341 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1744  TPR repeat-containing protein  38.84 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2067  TPR repeat-containing protein  40.37 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.885223  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1611  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1977  TPR repeat-containing protein  36.53 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2026  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1533  tetratricopeptide repeat protein  25.19 
 
 		 389 aa  53.1  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0644  tetratricopeptide repeat protein  25.19 
 
 		 388 aa  53.1  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132586  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0158  tetratricopeptide repeat protein  29.67 
 
 		 400 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.185124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0560  tetratricopeptide repeat protein  22.1 
 
 		 389 aa  50.1  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 870 aa  50.1  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1502  tetratricopeptide repeat protein  22.19 
 
 		 389 aa  46.6  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1546  TPR repeat-containing protein  20.92 
 
 		 397 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 466 aa  46.2  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02857  tetratricopeptide repeat protein  21.25 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1611  tetratricopeptide repeat protein  26.24 
 
 		 392 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0924  tetratricopeptide repeat protein  29.29 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.262727  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1068  tetratricopeptide repeat protein  29.29 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.26691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3010  tetratricopeptide repeat protein  24.49 
 
 		 390 aa  43.9  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00816471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2247  tetratricopeptide repeat protein  24.46 
 
 		 389 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1027  hypothetical protein  28.18 
 
 		 385 aa  43.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000719629  unclonable  0.0000000000401052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0906  hypothetical protein  28.18 
 
 		 384 aa  43.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.330727  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02118  tetratricopeptide repeat protein  24.5 
 
 		 389 aa  42.7  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000128021  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0967  tetratricopeptide repeat protein  31.63 
 
 		 384 aa  42.7  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3032  tetratricopeptide repeat protein  29.03 
 
 		 391 aa  42.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3221  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 392 aa  42.7  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0588004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>