16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0819 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0819  hypothetical protein  100 
 
 		 856 aa  1681    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0634  hypothetical protein  39.58 
 
 		 856 aa  593  1e-168  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0555  hypothetical protein  39.38 
 
 		 843 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1400  hypothetical protein  39.62 
 
 		 843 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.71275  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1887  hypothetical protein  31.09 
 
 		 849 aa  360  6e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1090  hypothetical protein  30.47 
 
 		 821 aa  324  3e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.665331  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1133  hypothetical protein  29.12 
 
 		 856 aa  321  3.9999999999999996e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0928  hypothetical protein  30.49 
 
 		 655 aa  294  6e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.903286  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1091  hypothetical protein  25.45 
 
 		 853 aa  290  7e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1045  hypothetical protein  25.86 
 
 		 921 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.665952  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  26.79 
 
 		 1144 aa  55.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  25.41 
 
 		 1061 aa  53.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  24.39 
 
 		 1061 aa  52.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  26.09 
 
 		 1104 aa  48.9  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  27.38 
 
 		 1079 aa  44.7  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  25.85 
 
 		 1070 aa  44.7  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>