20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0202 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0202  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  669    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0127748  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0109  hypothetical protein  51.53 
 
 		 315 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0149  hypothetical protein  51.53 
 
 		 315 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000393312  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0121  hypothetical protein  51.23 
 
 		 315 aa  306  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000688933  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1518  TPR repeat-containing protein  39.09 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00160085  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1745  TPR repeat-containing protein  36.75 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00037341  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0924  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  34.44 
 
 		 280 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.708476  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0694  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0490074  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1396  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.565148  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.23 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  20.75 
 
 		 278 aa  49.3  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  31 
 
 		 267 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  27.93 
 
 		 239 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  28.32 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  26.55 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 253 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1955  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0490064  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2243  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6122  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  29.67 
 
 		 335 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>