27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0567 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0567  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  258  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.939774  hitchhiker  0.00416939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  41.55 
 
 
550 aa  90.5  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  38.89 
 
 
540 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  41.26 
 
 
539 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  38.03 
 
 
523 aa  67.4  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  37.14 
 
 
555 aa  67.4  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  35.42 
 
 
551 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  29.69 
 
 
534 aa  65.5  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  38.46 
 
 
545 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  34.48 
 
 
566 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  40.37 
 
 
528 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  29.79 
 
 
531 aa  57  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.39 
 
 
534 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  39.16 
 
 
532 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  37.61 
 
 
529 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  33.8 
 
 
529 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  35 
 
 
565 aa  54.3  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  29.66 
 
 
548 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  36.04 
 
 
552 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  33.8 
 
 
532 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  29.7 
 
 
500 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  44.12 
 
 
561 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  44.76 
 
 
533 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  36.88 
 
 
541 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  36.81 
 
 
552 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  35.71 
 
 
555 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  38.51 
 
 
548 aa  41.2  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>