51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05430 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05430  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000667739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0012  tRNA-Glu  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0007  tRNA-Glu  92.75 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08980  tRNA-Glu  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013154 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0021  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0040  tRNA-Glu  93.62 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000576677  normal  0.10261 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t31  tRNA-Glu  93.62 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00120069  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0027  tRNA-Glu  93.62 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139828  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0015  tRNA-Glu  93.62 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00567316  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0047  tRNA-Glu  93.62 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00511598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0023  tRNA-Glu  93.62 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000272439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0041  tRNA-Glu  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000102386  normal  0.397694 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0182  tRNA-Glu  89.55 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0043  tRNA-Glu  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0981603  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0046  tRNA-Glu  88.06 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1490  tRNA-Glu  88.06 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0006  tRNA-Glu  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1710  tRNA-Glu  88.06 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1672  tRNA-Glu  88.06 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  88.06 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.990539  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2209  tRNA-Glu  88.06 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.35059  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0004  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0012  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.12218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0060  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0050  tRNA-Glu  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.199689  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0062  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.427189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0018  tRNA-Glu  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0027  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0066  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000193579  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0094  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.115481  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0030  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.437879  normal  0.359781 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0022  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2134  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00397523  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0002  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12539  normal  0.0346433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0023  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707978  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0005  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0015  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0015  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0084  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0070  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal  0.130321 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0029  tRNA-Glu  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0038  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0045  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0088  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0014  tRNA-Glu  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807422  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0012  tRNA-Glu  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0021  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.228053  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0745  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0011  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0018  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.141914 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0057  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0731133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>