13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1519 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1519  hypothetical protein  100 
 
 
1910 aa  3851    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.387558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1515  hypothetical protein  31.88 
 
 
873 aa  181  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1517  hypothetical protein  30.02 
 
 
895 aa  180  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5246  Carbohydrate-binding family V/XII  26.9 
 
 
562 aa  57  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  hitchhiker  0.0000498819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1054  hypothetical protein  26.89 
 
 
299 aa  54.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.52466  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1625  hypothetical protein  25.14 
 
 
579 aa  50.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0352  hypothetical protein  27.78 
 
 
1037 aa  50.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197071  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3610  hypothetical protein  27.27 
 
 
511 aa  49.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849775  hitchhiker  0.000658344 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3414  phage minor structural protein  27.34 
 
 
2399 aa  48.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1859  hypothetical protein  35.14 
 
 
262 aa  48.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1862  hypothetical protein  23.73 
 
 
318 aa  47.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3850  complement C1q protein  26.29 
 
 
781 aa  47.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  26.27 
 
 
1168 aa  47.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>