11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1315 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1315  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
236 aa  484  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00287797  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0488  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2150  type IV pilus assembly PilZ  27.63 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1670  type IV pilus assembly PilZ  24.44 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  25.98 
 
 
225 aa  63.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2389  type IV pilus assembly PilZ  23.98 
 
 
221 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16650  type IV pilus assembly PilZ  23.39 
 
 
216 aa  55.5  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0793  glycosyltransferase-like  25.45 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0542127  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0022  type IV pilus assembly PilZ  22.36 
 
 
229 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000212001  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0022  type IV pilus assembly PilZ  22.36 
 
 
229 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1745  type IV pilus assembly PilZ  23.04 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>