More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1200 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  62.58 
 
 
645 aa  852    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  50.62 
 
 
647 aa  673    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  50.07 
 
 
676 aa  652    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  54.69 
 
 
652 aa  734    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  49.92 
 
 
644 aa  636    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  49.7 
 
 
692 aa  649    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  50.15 
 
 
686 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  52.31 
 
 
647 aa  681    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  53.74 
 
 
635 aa  704    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  54.21 
 
 
635 aa  709    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  100 
 
 
642 aa  1334    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  48.66 
 
 
682 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  46.66 
 
 
689 aa  615  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  46.09 
 
 
704 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  47.6 
 
 
685 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  47.34 
 
 
716 aa  599  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  46.43 
 
 
714 aa  592  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  46.36 
 
 
678 aa  587  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  46.19 
 
 
687 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  45.68 
 
 
691 aa  582  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  45.9 
 
 
802 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  46.1 
 
 
681 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  44.44 
 
 
679 aa  561  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  44.79 
 
 
684 aa  552  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  46.12 
 
 
678 aa  554  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  43.83 
 
 
680 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  44.61 
 
 
686 aa  550  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  44.53 
 
 
679 aa  549  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  44.89 
 
 
690 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  44.83 
 
 
683 aa  543  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  45.21 
 
 
690 aa  544  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  44.33 
 
 
682 aa  543  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  43.56 
 
 
681 aa  544  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  44.53 
 
 
699 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  44.76 
 
 
690 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  45.13 
 
 
679 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  43.56 
 
 
680 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  43.56 
 
 
680 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  43.56 
 
 
680 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  43.71 
 
 
738 aa  528  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  43.78 
 
 
680 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  43.26 
 
 
680 aa  525  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  38.7 
 
 
650 aa  414  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  35.29 
 
 
600 aa  365  1e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  47.65 
 
 
846 aa  312  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  29.78 
 
 
573 aa  225  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  27.58 
 
 
576 aa  213  7e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  27.26 
 
 
576 aa  212  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  29.67 
 
 
575 aa  210  7e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  28.39 
 
 
587 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  27.47 
 
 
574 aa  206  9e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  28.86 
 
 
583 aa  202  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.21 
 
 
577 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  29.06 
 
 
566 aa  189  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.37 
 
 
566 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29 
 
 
566 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.48 
 
 
542 aa  182  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  27.32 
 
 
542 aa  178  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  27.74 
 
 
571 aa  178  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  28.67 
 
 
539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  24.96 
 
 
658 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  28.44 
 
 
567 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  26.61 
 
 
543 aa  173  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  29.87 
 
 
552 aa  173  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  28.14 
 
 
545 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  28.64 
 
 
556 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  26.75 
 
 
561 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  26.75 
 
 
561 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  27.74 
 
 
538 aa  169  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  24.08 
 
 
700 aa  168  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  24.93 
 
 
686 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  26.73 
 
 
553 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  27.42 
 
 
545 aa  168  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  27.59 
 
 
548 aa  167  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  28.73 
 
 
554 aa  167  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  26.86 
 
 
560 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  27.34 
 
 
552 aa  166  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  26.39 
 
 
561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.69 
 
 
577 aa  166  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  28.23 
 
 
541 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  27.86 
 
 
567 aa  165  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  25.04 
 
 
561 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  26.68 
 
 
559 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  25.44 
 
 
562 aa  164  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  28.27 
 
 
599 aa  164  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  27.71 
 
 
571 aa  163  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  24.45 
 
 
561 aa  163  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  28.04 
 
 
567 aa  163  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  26.32 
 
 
546 aa  162  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  24.88 
 
 
561 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1984  NAD synthetase  25.69 
 
 
584 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187378  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  25.45 
 
 
561 aa  161  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  26.69 
 
 
543 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.43 
 
 
591 aa  160  9e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  26.18 
 
 
564 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  26.62 
 
 
542 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  27.67 
 
 
582 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  27.14 
 
 
571 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2417  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  24.43 
 
 
626 aa  157  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.906393  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  28.24 
 
 
545 aa  157  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>