11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3500 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3500  hypothetical protein  100 
 
 		 899 aa  1777    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0001  shufflon protein, N-terminal constant region  50 
 
 		 418 aa  70.1  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0021  type IV pilus biogenesis protein PilV  44.05 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1510  prepilin  52.46 
 
 		 468 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59350  Type IV B pilus protein  52.73 
 
 		 442 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00610666  hitchhiker  0.0000000000033381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4478  type IV pilus protein PilV  52.73 
 
 		 459 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  31.11 
 
 		 689 aa  57  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4006  tail fiber protein H, putative  50 
 
 		 808 aa  52  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  33.58 
 
 		 790 aa  49.3  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0533  hypothetical protein  33.02 
 
 		 378 aa  48.5  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  45.24 
 
 		 691 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>