39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1511 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1511  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  100 
 
 
81 aa  157  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.416754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1046  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  73.97 
 
 
80 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3093  helix-turn-helix protein, CopG  69.86 
 
 
84 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5298  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  71.43 
 
 
84 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803296  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7136  hypothetical protein  67.14 
 
 
97 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1735  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50.7 
 
 
82 aa  76.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4222  hypothetical protein  46.05 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138741 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5432  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.67 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2088  transcriptional regulator  41.03 
 
 
85 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0268696  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01196  helix-turn-helix protein, CopG  41.1 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3749  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  59.65 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359793  normal  0.747078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2745  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.06 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.698152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1324  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  40.32 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.179973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2884  transcriptional regulator  43.75 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579696  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5158  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  53.85 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.491967  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3027  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  41.33 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2127  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  51.28 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114302  normal  0.153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5523  addiction module antidote family protein  34.67 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2652  hypothetical protein  51.28 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2489  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  35.53 
 
 
83 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.75624  normal  0.124302 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3568  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  47.37 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.951393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2938  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  46.15 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3206  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  41.18 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0460524 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  36.21 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3066  hypothetical protein  48.84 
 
 
88 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  37.7 
 
 
86 aa  43.9  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1824  hypothetical protein  46 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291634  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.5 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  32.39 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.330303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2396  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.1 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0710  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  35.82 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0441596  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6479  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  36.36 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0726  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  28.75 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0763324 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3498  hypothetical protein  46.51 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402745  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3830  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.1 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6369  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  30.99 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.547419 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3810  hypothetical protein  44.19 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2661  hypothetical protein  44 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1160  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  32.14 
 
 
83 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>