32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2336 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2336  YbbR family protein  100 
 
 
443 aa  844    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0269901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3985  YbbR family protein  43.16 
 
 
451 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1144  YbbR family protein  42.37 
 
 
451 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3417  YbbR family protein  29.98 
 
 
459 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  25.75 
 
 
316 aa  87  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0935  YbbR family protein  23.51 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2345  hypothetical protein  24.02 
 
 
440 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2659  hypothetical protein  24.02 
 
 
441 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2671  YbbR family protein  29.88 
 
 
401 aa  79.7  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1165  YbbR-like protein  22.51 
 
 
403 aa  67  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0430232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0200  hypothetical protein  23.02 
 
 
495 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3550  hypothetical protein  24.79 
 
 
413 aa  64.7  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0150  YbbR family protein  22.69 
 
 
503 aa  64.3  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2102  hypothetical protein  24.1 
 
 
294 aa  64.3  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659031  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0156  hypothetical protein  23 
 
 
495 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0149  YbbR family protein  21.01 
 
 
481 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.948785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0149  hypothetical protein  23.46 
 
 
493 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0179  hypothetical protein  22.64 
 
 
493 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0151  hypothetical protein  22.64 
 
 
493 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0157  hypothetical protein  22.64 
 
 
496 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0241  YbbR family protein  22.07 
 
 
415 aa  62.4  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0156  hypothetical protein  22.64 
 
 
496 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5136  hypothetical protein  23.18 
 
 
495 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0188  hypothetical protein  25 
 
 
493 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.315726  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0371  YbbR family protein  24.53 
 
 
311 aa  57.8  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1202  YbbR family protein  25.73 
 
 
414 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0362  YbbR family protein  21.17 
 
 
410 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1000  hypothetical protein  26.19 
 
 
218 aa  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000422798  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1287  hypothetical protein  24.79 
 
 
322 aa  50.1  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0293  YbbR family protein  22.96 
 
 
334 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0833  YbbR family protein  22.9 
 
 
437 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0297295  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1819  YbbR family protein  22.86 
 
 
239 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>