17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0312 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0312  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  170  6.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2349  hypothetical protein  41.38 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240227  normal  0.168126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1355  hypothetical protein  40.79 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000717055  normal  0.0110811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4046  protein of unknown function UPF0175  31.18 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2800  protein of unknown function UPF0175  34.21 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1082  hypothetical protein  32.31 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109568  normal  0.721009 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0409  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74354  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0161  protein of unknown function UPF0175  30.12 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1722  hypothetical protein  27.63 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5352  protein of unknown function UPF0175  29.49 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3500  hypothetical protein  37.97 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1083  hypothetical protein  26.92 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1485  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  42.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152276  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0647  hypothetical protein  34.85 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1353  protein of unknown function UPF0175  33.33 
 
 		 94 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00774094  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5307  hypothetical protein  32.05 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.276905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0158  protein of unknown function UPF0175  33.78 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>