10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6888 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6888  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  273  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0908877  normal  0.53378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4038  hypothetical protein  36.69 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31046  normal  0.0267217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4136  TadE family protein  34.06 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1229  hypothetical protein  34.06 
 
 		 133 aa  47.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172727  hitchhiker  0.00916576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2588  hypothetical protein  40.51 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0661216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1731  hypothetical protein  33.77 
 
 		 143 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000472333  normal  0.0606167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0677  hypothetical protein  32.58 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1312  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8594  hypothetical protein  34.33 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.433513  normal  0.881427 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0836  hypothetical protein  35.43 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0556219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>