10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1312 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1312  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  306  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4136  TadE family protein  40.56 
 
 		 149 aa  94.4  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2588  hypothetical protein  36.67 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0661216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1731  hypothetical protein  35.8 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000472333  normal  0.0606167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8209  hypothetical protein  28.15 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4038  hypothetical protein  36.76 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31046  normal  0.0267217 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3425  TadE family protein  42.31 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0677  hypothetical protein  40.62 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1229  hypothetical protein  32.84 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172727  hitchhiker  0.00916576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6888  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  40.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0908877  normal  0.53378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>