16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6077 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6077  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  877    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.596344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3073  hypothetical protein  37.27 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000435746  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1381  hypothetical protein  34.21 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3123  hypothetical protein  29.9 
 
 		 424 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.27337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2693  hypothetical protein  32 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3048  hypothetical protein  33.33 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3285  hypothetical protein  26.3 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2858  hypothetical protein  28.16 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.505703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8241  hypothetical protein  26.33 
 
 		 462 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3297  hypothetical protein  28.19 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514363  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3286  hypothetical protein  27.13 
 
 		 275 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3348  hypothetical protein  27.13 
 
 		 275 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160787  normal  0.0858239 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4197  hypothetical protein  24.93 
 
 		 749 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124038  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3551  hypothetical protein  29.61 
 
 		 275 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12217  hypothetical protein  28.86 
 
 		 257 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.616096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3244  hypothetical protein  37.4 
 
 		 391 aa  43.1  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00420433  normal  0.0463679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>